Dopo essere stata dei Benedettini, intitolata a S.Fortunato, fu consegnata con il Convento a S. Francesco che, ritornando dall' Oriente, era sbarcato in uno dei porti della Maremma. Restaurata ed ornata nel 1231, fu abbellita nel 1289 da Nello Pannocchieschi. La sua architettura e' di linea estremamente semplice; unici ornamenti sono una cornice che corre tutto intorno all' orlo del tetto, le finestre con arco a sesto acuto, una finestra circolare e una tettoia posta sopra la porta principale, terminante con una lunetta ove e' raffigurata una Madonna col Bambino e santi, ridipinta dal Casucci, che ha anche costruito il campanile, restaurato nel 1927. Ad eccezione della parte inferiore della facciata che e' in blocchi di travertino, tutta la costruzione e' in mattone brunito dal tempo che sottolinea la particolare nudita' dello stile francescano goticizzante. Stupendo e di altissimo pregio e' il grande Crocifisso dell' altare, opera attribuita a Duccio di Boninsegna e databile molto probabilmente al 1289 anno della riapertura al culto della chiesa ove e' conservato; il perizoma svolazzante rivela influenze di Cimabue, il suo schema ad esse pronunciato e la vivezza dei tratti del volto espirmono un rassegnato dolore.

La cappella di destra, che non fa parte architettonicamente della chiesa, e' dedicata a a S Antonio da Padova: la volta e la parete di fondo furono affrescate da Francesco e Antonio Nasini di Casteldelpiano che eseguirono il tra il 1651 e il 1680. Il chiostro attiguo, restaurato di recente e contemporaneamente alla chiesa, ha al centro un pozzo detto della Bufala, fatto costruire da Ferdinando dei Medici nel 1590 e, alle pareti, qualche pietra tombale stemmata e resti di affreschi. Un altro pozzo, costruito nel 1465 dai Senesi, si vede nell'attigua piazza dell' ex ospedale. Nel cortile della camera di commercio e' la bella abside romanica con lesene strette di sezione semicircolare, quasi semicolonnette, che raccordano il coronamento di archetti pensili con la base, della piu' antica chiesa di Grosseto (Xl XII sec.), intitolata a S Pietro, la cui facciata da' sul Corso Carducci.